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DELL工作站玩转高性能计算
IT解决方案 高性能计算 戴尔工作站 HPC T7920

DELL T7920工作站玩转高性能计算(HPC)

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搭建前的准备

高性能计算机也被称作并行计算机,由很多台计算机同时并行计算,以解决一个复杂的问题。搭建高性能计算的演示环境之前,需要有一些考虑和准备。

首先是HPC集群软件的选择。

目前,HPC系统越来越多运行的是Linux OS,入围世界Top500的超级计算机100%采用的都是Linux系统。为了帮助用户更方便地搭建和使用HPC,Linux基金会成立了OpenHPC项目组,将软件包预先编译搭建好,这样用户就可以通过标准的Linux安装流程,快速安装部署一套HPC系统。

因此本次HPC演示环境搭建采用了OpenHPC软件,其网址为http://openHPC.community。以下是OpenHPC集群的架构图:

其次是OpenHPC软件模块。

OpenHPC可以支持的操作系统有CentOS,SuSe Linux,集群管理软件有Warewulf和xCAT,作业调度软件有PBSpro和Slurm等。考虑到CentOS用户比较多,Warewulf相对简单,PBSpro在国内有商业厂商支持,所以本次安装OpenHPC选择了CentOS、Warewulf和PBSpro的组合。

最后是T7920上的虚拟平台。

公司配的做计算与渲染的T7920工作站一台【配置:戴尔(DELL) T7920塔式图形VR工作站渲染仿真计算设计师台式电脑主机 1颗至强金牌6126 十二核 2.6GHz/16G内存/512GSSD+2T/RTX2080-8G】,运行Windows10  Enterprise。

由于需要创建虚拟主机,可以考虑采用的虚拟主机平台主要有三种:VMware Workstation 15 Player,  Oracle VM VirtualBox 和微软的Hyper-VManager。

由于VMware Workstation Player免费版本不可以同时支持多个VM(虚拟机)的运行,Oracle VirtualBox 的VM安装CentOS7.6时会出现鼠标点击无效的Bug,所以本次部署采用的是Windows10 Hyper-V

万事俱备,即刻开始搭建HPC运行环境!

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HPC运行环境搭建八步走


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Windows10 Hyper-V虚拟平台的设置

开启Hyper-V模式支持:

在搜索栏输入“turn windows features”,进入配置窗口,勾选Hyper-V复选框,随后重启Windows10。

运行Hyper-V:

在搜索栏输入“Hyper-V Manager”,启动Hyper-V manager,随后将Hyper-V Manager连接到服务器:点击右侧的连接到服务器,选择本地,即这台T7920工作站,本电脑的名字为“*DST2”。

2
创建OpenHPC的管理节点——sms,并安装CentOS 7.6 操作系统

点击左侧的服务器“*DST2”,随后点击右侧的“New”,在弹出的菜单栏中选择“Virtual Machine”。

按照创建VM导航,创建OpenHPC的管理节点,在”name“处输入sms,作为VM的名字;随后选择Hyper-V支持的VM类型:第一代“Generation 1”,申请内存空间为2GB(CentOS最少需要2GB的内存,硬盘容量建议为40GB)。

配置网络连接为连接外部网络”external”交换机,配置VM的本地硬盘为40GB

OpenHPC支持的最新版本为CentOS7.6,可以在http://vault.centos.org/7.6.1810/isos/x86_64/CentOS-7-x86_64-DVD-1810.iso将CentOS7.6下载到本地。然后在Image file (.iso)处,指定CentOS ISO 文件的本地路径。

完成设置后进入总结页面,点击“Finish”完成。

开启sms的VM,在Virtual Machines的窗口中选择sms后,点击右侧菜单“action”下属“sms”的“connection”,连接完成后,点击弹出窗口“action”下的“start”开始。

开始在sms vm虚拟机上安装CentOS7.6。选择”English”语言,时区可以选择“Shanghai,China”,在“Language Support”支持语言中点击“简体中文”。在software selection 中,安装最小包——带有Gnome Application图形界面的软件包。

随后按照提示步骤进行配置,配置“Installation Destination”,然后等待大约2分钟,检测“Installation Source”完成,就会出现以下界面。

点击“Begin Installation”开始安装,约安装1398个软件包,在此期间需要设置root的密码口令:

估计运行14分钟,就可以完成OS的安装。按“reboot”重启,在”Initial Setup”中,接受License许可。配置主机名和网络,将主机名设定为”sms”,网络eth0设置为”ON”开启。

这里需要添加一个用户名,如“test“,输入口令,跳过google等用户注册,完成CentOS7.6 的安装。随即以“test“用户登录到系统,我们需要用root登录,点击右上角的开关按钮,选择”logout”退出用户“test”,然后用root重新登录系统。

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配置OpenHPC sms 管理节点的网络

配置Hpyer-v Switch网络

进入Hyper-v manager,通过“Virtual switch manager”创建2个网络,一个是“External”的OpenHPC External,用于连接外网Internet的访问,将连接sms的eth0网卡;一个是“Private”的OpenHPC Private,用于HPC集群的内部管理。

在Windows10的网络配置中,OpenHPC ExternalvEthernet (default)设为共享。右键v Ethernet ,OpenHPC External 的网卡,点击Properties ->Sharing,在Internet Connection Sharing的下拉菜单中选择vEthernet(Default Switch)。

配置sms节点的网络接口。在sms控制台上创建2个网络接口卡eth0,连接external网,eth1,连接private 网络。

重新连接sms,并start,用root登录后,启动一个terminal,运行

#pingwww.sohu.com,或者其他网络网址如www.sina.cn,可以ping通。(www.sohu.com或www.sina.cn是代表互联网上的一个主机名字,对应各自的IP地址,如果可以ping通,即表示可以和Internet网络连接。)

#yum list installed, 可以显示yum 运行正常。

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sms节点的配置和OpenHPC发行版本软件安装

设置再次确认和配置主机名  

#hostnamectl set-hostname sms

#hostname

可以显示主机名已经修改;

重新启动一个terminal,可以在提示符处,看到名字改为sms;

设置eth1网络接口IP地址为172.16.0.1/16,可以通过网络配置工具。

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